Très peu d'informations nous sont parvenues sur la maison du Temple de Vuillecin. Néanmoins, nous savons que celle-ci dépendait de la commanderie de Salins-les-Bains.

La fondation de la maison de Vuillecin doit son origine à des dons effectués par les seigneurs de Joux.

La chapelle qu'on peut voir actuellement a été reconstruite en 1852 à l'emplacement de l'ancienne chapelle du Temple et en gardant son style d'antan.