On ne connait que peu de choses sur la commanderie de Falletans, mais il semblerait qu'un don fait par le comte de Bourgogne, Renaud III⁽¹⁾dans les années 1130-1132 soit à l'origine de sa création.

Avant son élection comme maître de l'Ordre en 1151, Bernard de Tremelay était commandeur du Temple-les-Dôle.
On peut donc raisonnablement penser que cette commanderie était très importante dans l'organisation de l'Ordre et qu'elle s'est rapidement développée entre la date de la première donation et la maîtrise de Bernard de Tremelay en 1151.

Arrivée en possession des Hospitaliers de Saint-Jean en 1312, la commanderie restera occupée jusqu'en 1791 où elle sera vendue comme bien national suite à la Révolution.

De l'importante commanderie fortifiée, ceinte d'une muraille et flanquée de tours, il ne reste que les vestiges du bâtiment principal qui sont encore visibles actuellement.