On ne connait pas exactement la date de l'installation de l'Ordre Teutonique à Cheb (Eger), mais on sait que le domaine lui a été donné par le roi de Germanie, Conrad IV de Hohenstaufen au cours de son règne, donc entre 1237 et 1254.

En 1258, l'Ordre obtient les droits paroissiaux de la ville et commence la construction d'un hopital et d'une école. C'est aussi sans doute à ce moment que la commanderie en elle-même est créée.

En 1259, le pape Alexandre IV confirme la donation initiale ainsi que l'établissement de la commanderie.

Située dans l'évêché de Ratisbonne, la commanderie était ratachée lors de sa création au bailliage teutonique de Thuringe, avant d'être rattachée à la Bohême en 1322 lorsque la ville quittera le giron germanique pour être mise en gage par le roi Louis III de Bavière au roi de Bohême Jean de Luxembourg.

En 1341, le Maître de l'Ordre (Dietrich von Altenburg ou Ludolf König von Wattzau car le premier décède cette année là et l'autre est nommé cette même année) autorise le commandeur à tenir une bibliothèque reprenant l'ensemble des livres apportés par les frères de l'Ordre arrivant dans la commanderie et qu'ils y laisseront à leur décès.

Au milieu du 15^ème siècle, l'effectif de la commanderie s'élevait à 13 frères, et un siècle plus tard, il était d'une trentaine de frères. L'ensemble des bâtiments se trouvait à côté de l'église paroissiale de la ville, mais tout a disparu de nos jours.

Les possessions de la commanderie comprenaient de vastes domaines agricoles, des forêts, prairies, étangs, des droits de chasse, de nombreuses rentes foncières et de nombreuses paroisses dans les environs d'Eger, mais aussi dans l'actuel Haut-Palatinat⁽¹⁾.

Au milieu du 16^ème siècle, le protestantisme commence à sétendre dans la région et provoque une série de troubles qui sonneront le début du déclin de la commanderie. Au début du 17^ème siècle, un accord est conclu entre l'Ordre et la ville de Eger qui devient propriétaire de la commanderie.

Une vingtaine d'années plus tard, en 1627, l'empereur du Saint Empire et roi de Bohême Ferdinand II⁽²⁾ ordonne à la ville de Eger de céder la commanderie à Christoph Simon von Thun⁽³⁾, Prieur de l'Ordre de Malte. Ce Christoph Simon von Thun devient alors le premier commandeur de l'Ordre de Malte de Eger, mais la gestion du domaine sera transférée à un intendant laïc seulement quelques semaines après le transfert de propriété, vers la fin de 1627. Tout aussi peu rentable que pour l'Ordre Teutonique, la commanderie sera à nouveau revendue à la ville à la fin du 17^ème siècle.